Chaque année, un certain nombre d'êtres humains sont tués par des crocodiles. Les espèces les plus redoutées sont le crocodile marin (en Australie) et le crocodile du Nil (en Afrique). Généralement, les populations locales connaissent le danger que représentent ces grands reptiles et savent comment se comporter pour diminuer les risques.
Mais inversement, de nombreuses espèces de crocodiliens sont menacées par l'homme, suite à la chasse, à la diminution des proiess, l'aménagement ou la destruction des zones humides. Certains, comme le crocodile du Siam ou le crocodile des Philippines, ont presque disparu dans la nature à l'heure actuelle. Heureusement, d'autres espèces ont pu être sauvées grâce à des mesures de protection efficaces : c'est le cas notamment de l'alligator dans le Sud des Etats Unis.